生物学071000（全日制学术型硕士）
生物学学位点前身为1985年由北京大学创建的生物化学、微生物学专业，后经多次优化调整，办学规模不断扩大。生物学学科依托生物学国家级一流本科专业建设点、山东省“学科特区”优势学科、2005年获批的海洋生物学二级学科硕士点，于2011年获批一级学位硕士点，2018年顺利通过国家一级硕士学位点评估。学科秉持科教并重、创新发展的人才培养理念，以培养德智体美劳全面发展、具有良好的生物学专业素养和创新能力的高质量专业人才为目标，基本形成了结构和布局合理的研究生教育培养体系。本学科紧紧围绕生物学发展特点，主动对接区域经济发展需求，建立了特色明确、优势突出、多学科交叉融合的学科体系，现已形成植物学、水生生物学、微生物学、生物化学与分子生物学4个培养方向。
食品科学与工程083200（全日制学术型硕士）
食品科学与工程学科始于1984年清华大学援建，2010年后逐步发展为山东省特色专业、高水平应用型专业群核心专业，2019年获批山东省一流本科专业。作为一级学科硕士点，其研究方向聚焦食品科学、农产品加工及贮藏工程、食品安全、食品营养与健康四大领域，依托山东省功能食品工程技术研究中心、海产品质量与安全检测重点实验室等省级平台，形成“海洋食品加工与安全”“功能食品开发”等特色方向。
生物工程083600（全日制学术型硕士）
生物工程学位点2018年获首批生物工程一级学科硕士学位授权。学科秉承“理工优势互补、服务区域发展、产教融合”等发展理念，在代谢控制发酵、藻类生物资源开发与利用、海洋生物制品制备与产品研发、微生物资源开发与利用、生物制药与载体材料、农业种质创制及农产品加工等方面形成了理论研究与工程开发应用的学科优势与成果。生物工程学科作为我院重点发展的学科方向，始终围绕生命科学前沿领域与实际应用需求设置招生专业方向，现有微生物发酵工程、合成生物工程、生物过程工程、医药生物工程四个研究方向。
农艺与种业095131（全日制专业型硕士）
2013年烟台大学与山东省烟台市农业科学研究院共同签署合作协议，联合创办烟台大学农学院，同年获得农艺与种业专业硕士学位授予权，在作物、园艺、植物保护三个领域招收培养全日制硕士研究生。农艺与种业硕士点契合了国家粮食安全、农产品供给侧改革及农民增收的战略，秉承立足本地、面向全国的办学宗旨。以培养“厚基础、宽口径、强能力、高素质、广适应”的高层次、实用型复合人才为目的，结合农艺与种业领域专业硕士学位培养的特点和需求，大胆尝试、勇于探索，实现了课堂理论教学与现场实践教学环节密切结合与交融互补。
生物技术与工程086001（全日制、非全日制专业型硕士）
生物技术与工程专业自2020年以来持续面向全日制与非全日制学生进行招生。该专业作为生物与医药硕士专业学位类别的重要领域之一，主要培养在生物技术与工程相关行业，如生物制药、生物农业、生物制造等领域，具备扎实专业基础、较强工程实践能力与创新能力的应用型、复合型高层次工程技术人才。其依托学校在生命科学、化学等多学科的综合优势，为学生提供全面且深入的专业知识学习与实践技能培养平台。
食品加工与安全095135（全日制、非全日制专业型硕士）
食品加工与安全领域农业硕士是与优质农产品或优质食品原料生产、农产品加工与食品制造、食品质量安全控制及监管等方面任职资格相联系的专业学位。以发展现代农业和食品产业为宗旨，为相关企事业单位和管理部门培养具有坚实的基础理论和宽广的专业知识，能够独立承担食品加工与安全相关的专业技术或管理工作，具有较强的解决实际问题的能力和创造力，具有良好职业道德的应用型、复合型高层次人才。学科围绕食品科学、农产品加工与储藏、食品安全以及食品营养等方向展开了深入地研究，并服务于烟台市、山东省乃至全国范围内的众多食品相关企业。
食品工程086003（全日制专业型硕士）
食品工程是以化学、物理学、生物学等基础学科和工程学为基础，面向农产品可食性原料、制品和食品的加工、贮存、保鲜、流通、监管等关键过程技术与应用的工程领域，涵盖食品加工与制造、食品质量与安全、食品营养与健康、食品新资源挖掘、食品机械与智能装备、食品合成生物、食品工业管理等研究方向，是衔接食品科学与工程应用的重要桥梁。